Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms