Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BP99 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BP99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BP99 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BP99 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BP99 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Q8BP99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BP99 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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