Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trim6Q8BGE7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim6Q8BGE7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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