Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mindy1Q76LS9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mindy1Q76LS9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms