Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms