Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Akap4Q60662 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Akap4Q60662 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms