Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema5bQ60519 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms