Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trdv2-2Q5R1A4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms