Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm3558Q5FWC9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm3558Q5FWC9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3558Q5FWC9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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