Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM3Q53FZ2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms