Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc47Q505F5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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