Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms