Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nkain3Q3URJ8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nkain3Q3URJ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms