Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1aQ2LKU9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms