Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300lgQ1ERP8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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