Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scg2Q03517 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms