Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mc1rQ01727 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mc1rQ01727 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms