Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Acta1P68134 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Acta1P68134 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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