Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps28P62858 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms