Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acta2P62737 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Acta2P62737 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms