Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc13P50207 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms