Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtbP41155 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtbP41155 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtbP41155 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtbP41155 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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