Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoc1P34928 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoc1P34928 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms