Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms