Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RxrbP28704 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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