Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

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Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HdcP23738 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HdcP23738 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HdcP23738 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HdcP23738 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HdcP23738 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HdcP23738 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HdcP23738 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms