Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRHP20396 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRHP20396 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRHP20396 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRHP20396 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRHP20396 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRHP20396 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRHP20396 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRHP20396 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRHP20396 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms