Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB1P04280 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRB1P04280 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRB1P04280 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms