Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Aff2O55112 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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