Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip3O55003 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bnip3O55003 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms