Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phox2bO35690 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms