Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20939L7N243 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms