Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm19965J3QNY8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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