Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21818J3KMS6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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