Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Frmpd4A2AFR3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms