Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdc27A2A6Q5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms