Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top3bQ9Z321 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top3bQ9Z321 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms