Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms