Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms