Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr54Q9R0D8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms