Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Npas3Q9QZQ0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms