Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl40Q9D783 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl40Q9D783 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms