Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms