Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitrm1Q8K411 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms