Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r188Q8K3N2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms