Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms