Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim6Q8BGE7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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