Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sp4Q62445 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms