Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms