Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms